Orang yang menderita anemia aplastik mungkin akan kesulitan membedakannya dengan anemia biasa. Gejalanya termasuk jarang terjadi dan sering kali tidak spesifik, sehingga sulit untuk didiagnosis.
Masih menurut Mayo Clinic, gejala anemia aplastik mungkin tidak muncul, namun jika ada, beberapa gejala yang mungkin terjadi antara lain kelelahan, sesak napas, detak jantung tidak teratur, kulit pucat, infeksi yang sering, memar mudah, mimisan, gusi berdarah, pendarahan yang berkepanjangan, ruam kulit, pusing, sakit kepala, dan demam.